В Республике Башкортостан описторхоз впервые был зарегистрирован сотрудниками 1 –ой Башкирской (160-ой Союзной) гельминтологической экспедицией, которая  работала в республике в 1938 году. В печени у двух кошек, исследованных в Бирском районе М.П. Гнедина (1938) обнаружила Opisthorchis felineus (Rivolta, 1884).  По данным Ф.Ф. Мусыргалиной (2000) описторхоз среди людей имеет значительное распространение, особенно среди населения деревень прирусловой зоны рек Камы и Белой.
    Выявление новых очагов описторхоза, определение степени зараженности различных видов животных и рыб на территории Башкортостана имеет определенный научный и практический интерес.
Нами в 2000 году в 7 районах республики (Архангельский, Баймакский, Бирский, Гафурийский Кушнаренковский, Краснокамский, Уфимский,) было обследовано 7 водоемов (5 рек, 2 озера). Методом гельминтологических вскрытий по К.И. Скрябину (1928) было исследовано 286 экз. рыб  принадлежащих 13 видам (карась – 65, плотва –66, красноперка –16, налим – 1, окунь –13, голавль –2, стерлядь –33, язь –12, линь –6, карп –12, лещ –45, сазан –8, чехонь –7). Метацеркарии описторхисов были обнаружены в мышцах только двух экз. (12,5%) рыб (красноперка).
Гельминтологическому вскрытию были подвергнуты печени от 200 свиней, 5 кабанов, 1 бурого медведя, 5 голубых песцов. При этом описторхисы у этих животных не были обнаружены.
По данным Республиканского центра санитарно- эпидемиологического надзора по состоянию на 1 января 2001 года описторхоз среди людей выявлен в следующих городах республики: Уфа, Бирск, Нефтекамск, Октябрьский, Салават, Стерлитамак (за 1999 г от 0,6 до 3,1% из числа обследованных людей). Как показывают отчеты управления ветеринарии МСХ и П Башкортостана и отчеты кафедры паразитологии Башкирского госагроуниверситета о ранее проведенных исследованиях у собак и кошек описторхисы обнаружены в следующих районах:  Краснокамском (д. Н.Березовка, д. Ст. Янзигитово),  Бирском (д. Ст. Калинники, д. Криуши),  Благовещенском (г. Благовещенск, д. Н.Турбаслы), Иглинском (д. Акберды, д. Карамалы), Гафурийском (д. Антоновка),  Мелеузовском (д. Акназарово, д. Кузнецовск),  Кугарчинском (д. Верх-Виккузино, Карбутнино, д. Мраково, д. Юмагузино),  Уфимском (мелькомбинат), у 30% кошек из 89 исследованных и у 11% собак из 18 исследованных.
Как показывает анализ отчетов Республиканского центра санитарно-эпидимиологического надзора, эпидемиологическая ситуация по описторхозу в республике характеризуется следующими данными. В 1995 году описторхоз был выявлен у 8 человек, в 1996 году у 9, в 1997 году у 10 , в 1998 году у 14, в 1999 году у 25, в 2000 году у 24 человек.  Как показывают эти цифры, количество больных описторхозом людей  ежегодно растет. Как полагают специалисты республиканского центра санитарно-эпидемиологического надзора заражение населения республики описторхозом происходит за счет употребления в пищу рыбы, завезенный в РБ из других регионов страны, в эпизоотологии и эпидемиологии описторхоза  значительную роль играют специалисты нефтяной промышленности, работающие в районах Сибири вахтовым методом.
Болезнь в Башкортостане имеет ярко выраженную очаговость, она приурочена к водоемам бассейнов рек Кама и Белая, где имеются благоприятные условия для развития и сохранения возбудителя. Наибольшее значение имеют промысловые рыбы, зараженные личинками гельминта и широко используемые в пищу населением. Метацеркарии описторхисов обнаружены у 9 видов рыб (лещ, голавль, плотва, линь, густера, уклея, красноперка, пескарь, язь).
Организация надежной профилактики описторхоза для республики представляет важную социальную и экономическую проблему и должна осуществляться комплексно, гармоничными усилиями медицинских и ветеринарных специалистов с привлечением  руководителей хозяйств, организаций и предприятий, в соответствии с утвержденным “Планом управления ветеринарии МСХ и П РБ по профилактике описторхоза”, в котором предусмотрено проведение в очагах инвазии плановых лабораторных исследований фекалий людей, организация исследований специалистов нефтяной промышленности, выезжающих вахтовым методом в регионы Сибири, а также беженцев, которые могут являться распространителями описторхоза. Зараженные люди должны подвергаться обязательной дегельминтизации с использованием эффективных препаратов.