Специалисты ихтиологи и гидробиологи должны иметь знания по ихтиопаразитологии не только для общего развития, но и по долгу службы, работая непосредственно с объектами естественных и искусственных водоемов. В связи с этим изучение ихтиопаразитологии на биолого-почвенном факультете Томского государственного университета  осуществляется в плане спецкурса по кафедре ихтиологии и гидробиологии с 1976 года, в объеме 38 часов лекционных и 48 часов большого практикума. Главная цель предмета изучить основные паразитарные болезни рыб, при этом особое внимание обращается на заболевания передающиеся от рыб человеку.
 Первая лекции начинается традиционно, т. е. с истории возникновения науки ихтиопаразитологии, при этом подчеркивается особая заслуга отечественных паразитологических школ. (Е.Н. Павловского, В.Н. Беклекмишева, В.А. Догеля). В последующих лекциях освещаются, в основном, наиболее опасные и широкораспространенные инвазионные болезни рыб вызываемые простейшими (миксоспоридиозы, хилодонеллез, ихтиофтириоз, триходинозы, апиозомозы и др.), низшими червями (трематодозы, моногеноидозы, цестодозы, акантоцефалезы, нематодозы), высшими червями (бделозы), ракообразными (эргазилезы, лернеоз, аргулез), и паразитическими личинками моллюсков – глохидиями. Из простейших наибольшее внимание уделяется вобудителям миксоспоридиозов, которые встречаются исключительно у рыб, считаются широкораспространнеными и слабоизученными, особенно, в Сибири. Они вызывают такие тяжелые заболевания как сфероспороз карпа, желтуху и вертеж форели, злокачественную миксоспоридиозную анемию карпа, шишечную болезнь усачей, язвенную болезнь лососевых, щук и др. Среди низших червей особый интерес представляют моногенеи, а именно гиродактилиды, так же слабо изученные в Сибири и способные вызвать массовую гибель молоди рыб. Паразит, поселяясь на коже, плавниках и жабрах хозяина разрушает ткань, нарушает процесс дыхания. Из крустацеозов большое значение имеет аргулез, заболевание вызываемое карповой вошью, паразит, питаясь кровью хозяина, инвазирует его кровепаразитами и способствует заражению краснухой.
Изучаются систематика, морфология, жизненные циклы возбудителей, клиника, эпидемиология, меры борьбы и профилактика заболеваний. Приходится касаться и некоторых наиболее известных и  тяжелых инфекционных заболеваний рыб, таких как краснуха, воспаление плавательного пузыря карпа, фурункулез лососевых, сапролегниозы. Из незаразных болезней рассматриваются алиментарные, функциональные и болезни невыясненной этиологии. Дается понятие, что такое болезнь и причины ее возникновения, как проявляется нарушение обмена веществ у рыб, классификацию и распространение опухолей, организация борьбы с болезнями рыб в России. При этом особо  подчеркивается важная роль профилактических мероприятий проводимых в рыбоводных хозяйствах и естественных водоемах,
 В программу лекционного курса включены и некоторые вопросы общей паразитологии. Такие как различные формы связи между организмами, различные формы связи паразита и хозяина, происхождение эктопаразитизма, эндопаразитизма и кровепаразитизма, морфологические адаптации паразитов к их образу жизни, воздействие паразита на хозяина, реакция хозяина на паразита и все это применительно к системе паразит – рыба. Кроме того, дается определение и понятие явления специфичности,  природной очаговости заболеваний передающихся от рыб человеку. В нескольких лекциях  разбираются проблемы экологической паразитологии на примере паразитов рыб. Это   хозяин – паразит как система, рост популяции паразита, регуляция и  устойчивость систем паразит – хозяин, межвидовые и внутривидовые взаимоотношения паразитов, взаимоотношения паразитов и симбионтов в организме рыб. Большое внимание уделяется изучению вопроса взаимодействия паразитофауны и среды. Рассматривается зависимость паразитофауны от возраста,  пищи, образа жизни рыб, сезона года, географических факторов, влияние на паразитофауну хозяйственной деятельности человека.
На практических занятиях изучаются микро и макропрепараты паразитов возбудителей болезней рыб из разных систематических групп, проводится их определение, описание и зарисовка (некоторые мелкие формы паразитов зарисовываются с помощью рисовального аппарата). Осваивается методика измерения паразитов и расчет цены деления микроскопа.  В конце изучения каждой систематической группы паразитов проводится вскрытие рыб с целью овладения методикой полного и неполного анализа рыб, сбора паразитов, приготовления из них временных и постоянных препаратов. Подсчитывается экстенсивность и интенсивность заражения. Одно из занятий посвящено исследованию паразитов передающихся от рыб человеку. Изучаются жизненные циклы, инвазированность промежуточных и окончательных хозяев с последующим вскрытием карповых и хищных рыб. Найденных, метацеркариев и плероцеркоидов  окрашивают, обезвоживают и заключают в канадский бальзам для последующего определения.