В последние годы имеется отчетливая тенденция роста заболеваний, вызванных «нетрадиционными» возбудителями бактериальной, вирусной и протозойной природы, среди которых не последнее место занимает криптоспоридиоз.
Криптоспоридии – важные и широко распространенные агенты, вызывающие желудочно-кишечные заболевания (расстройство функций, диарея, рвота, болезненность, вялость) у животных и людей.
Широкое распространение данного заболевания связано с большим количеством природных резервуаров инфекции, низкой инфицирующей дозой и высокой резистентностью возбудителя к дезинфектантам и противопаразитарным препаратам.
По данным [1, 6], а также  [4, 5] 37% болезней вызывает неблагоприятная экологическая обстановка, влияющая на общую заболеваемость не только людей, но и животных.
Территория Республики Мордовия характеризуется высоким техногенным загрязнением окружающей среды, особенно после катастрофы на Чернобыльской АЭС. Различные токсиканты, попадая в организм животного, вызывают задержку его роста и развития, приводя к проявлению иммунодефицитных состояний, возникновению различных заболеваний, а криптоспоридии вызывают тяжелую патологию при дисбалансе иммунитета у хозяина и отягощают общее течение болезни [7, 2, 3].
Целесообразно широкое проведение исследований на криптоспоридиоз животных и людей с длительными диареями, сопровождающимися дисбактериозом кишечника, вероятно криптоспоридиоз встречается значительно чаще, чем диагностируется. Основной механизм передачи инфекции фекально-оральный.
Заражение происходит при непосредственном контакте с инфицированным животным или человеком, а также с объектами окружающей среды, контаминированными криптоспоридиозами. Доза ооцист, при которой происходит заражение, очень мала – при 1000 – 100%, при 132 – 50%, при 30 – 20%.
Повышение восприимчивости к этой инвазии вызвано ростом вторичных иммунодефицитов из-за ухудшающейся экологической ситуации, не качественного питания и водоснабжения, широкого применения антибиотиков и других лекарственных препаратов. Водный путь распространения является основным путем передачи возбудителя. Опасность состоит  в том, что большинство современных технологий не позволяет добиться очистки воды от криптоспоридий. Это связано с резистентностью ооцист к дезинфектантам, к хлорированию и с малыми размерами ооцист, позволяющими проходить через многие фильтры.
Факторами передачи могут являться продукты, в том числе и животного происхождения (молоко).
Закономерности распространения инвазии в зависимости от времени года нет. Пик интенсивности заболевания – весна (с апреля по июнь), резкое снижение – осенью (с августа по ноябрь). Сезонность криптоспоридиозной инвазии связана с источниками распространения болезни. Первичными источниками для молодых животных являются синантропные и дикие грызуны, кошки. В популяции грызунов криптосопоридии обнаруживаются в течение всего года, следовательно, они могут быть резервуаром и потенциальным источником распространения болезни. Выделяемые ими ооцисты контаминируют окружающую среду, в которой находятся  восприимчивые молодые животные. Высокая степень инвазии среди животных весной, когда наблюдаются выделения большого числа ооцист грызунами, а также кошками, имеющими с ними экологические и трофические связи. Это приводит к перезаражению здорового поголовья животных [6].
Основным источником заражения являются больные  и переболевшие животные, выделяющие ооцисты с экскрементами. Загрязненные ооцистами предметы окружающей среды (помещения ферм, корма, предметы ухода за животными и т.д.) становятся постоянным источником инвазирования восприимчивых к заболеванию животных.
По нашим данным, за 11 лет проведенных исследований криптоспоридиоз новорожденных поросят и телят хотя не одинаково, но встречается во всех агроклиматических зонах. Процент распространения колеблется от 0,1 до 52,3% у поросят и от 0,1 до 96,3% у телят.