Антипролиферативный потенциал растения Uncaria Tomentosa («Кошачий коготь») позволяет считать его одним из перспективных источников лекарственных препаратов в профилактике и в комплексном лечении онкологических заболеваний [2]. Эффекты данного растения изучаются во многих странах (Бразилия, Перу, Япония, Китай и др.). При этом ни в одной стране мира препараты на основе Uncaria Tomentosa не зарегистирированы как противоопухолевые средства или препараты для вспомогательной терапии опухолевых заболеваний. Это оставляет открытым вопрос об отдаленных последствиях применения Uncaria Tomentosa, в том числе, вопрос о возможной стимуляции метаста-зирования. Нами проведено исследование взаимодействия активных компонентов экстракта Uncaria Tomentosa с рецептором внутриэндотелиального фактора роста (VEGFR). Поскольку, именно данный фактор играет ключевую роль в процессе метастазирования опухоли, обеспечивая неоангиогенез.

В настоящее время с помощью методов биоинформатики представляется возможным исследование способности компонентов Uncaria Tomentosa влиять на ключевые молекулярные элементы метаболических путей опухолевого процесса. Технология in silico представляет из себя набор вычислительных методов, позволяющих с разной степенью физичности на атомарном уровне изучать молекулярные системы разной сложности, в том числе взаимодействия типа лиганд-рецептор. Целью данной работы является изучение влияния компонентов экстракта на сайт связывания рецептора внутриэндо-телиального фактора роста.

В качестве лигандов были использованы модели оксиндолалкалоидов экстракта Uncaria Tomento-sa, найденные в банках данных PDB NCBI RCSB, KEGG, KEGG PLANT, U.S. National Library of Medicine ChemlDplus Advanced. Модель рецептора VEGFR взят из базы PDB NCBI RCSB. Процесс укладки лиганда в лиганд-связывающий центр рецептора, то есть молекулярный докинг проводился с помощью программы AutoDock [1], в которой используется гибридный Ламарковский генетический алгоритм.
Результаты, полученные с помощью программы AutoDock, позволили нам проанализировать минимальную энергию связывания лиганда с макромолекулой, вероятность нахождения лиганда в активном центре белка в положении, отвечающем наименьшей энергии связывания. Значение минимальной энергии связывания оказалось положительным ^св=0,58-0,96) во всех проведенных экспериментах. Это говорит о неспособности исследуемых лигандов связывать VEGFR и оказывать на него какое-либо влияние, поскольку данный показатель при сродстве к активному центру рецептора должен иметь отрицательное значение.

Данный результат, полученный in silico, говорит об отсутствии воздействия активных компонентов исследуемого растения на процесс неоангиогенеза, который возникает при стимуляции рецептора внутриэндотелиального фактора роста. Учитывая данные литературы о противоопухолевом потенциале оксиндолалкалоидов Uncaria Tomentosa, можно предположить пригодность извлечений из этого растения на роль кандидатов для разработки средств для дополнительной и вспомогательной терапии опухолей, а также для профилактики метастазирования при удалении первичного опухолевого узла традиционными методами.