Labirint.ru - ваш проводник по лабиринту книг
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -ГлавнаяОб АльманахеРецензентыАрхив телеконференций- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -Сборники АльманахаДругие сборникиНаучные труды- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -Образец оформленияИнформационное письмоО проведении телеконференции- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -Материалы I телеконференцииМатериалы II телеконференцииМатериалы III телеконференцииМатериалы IV телеконференцииМатериалы V телеконференцииМатериалы VI телеконференцииМатериалы VII телеконференцииМатериалы VIII телеконференцииМатериалы IX телеконференцииМатериалы Х телеконференцииМатериалы XI телеконференцииМатериалы XII телеконференцииМатериалы XIII телеконференцииУчастники XIII телеконференцииМатериалы XIV телеконференцииУчастники XIV телеконференцииЮбилейная XV Телеконференция Октябрь 2014Участники Юбилейной XV Телеконференции- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -Конференция СМПиЧ-2015Участники СМПиЧ-2015- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -КонтактыФорум
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -Поиск по сайту

Последние статьи

ФУНКЦИОНАЛЬНАЯ АКТИВНОСТЬ ЛИМФОЦИТОВ У БОЛЬНЫХ ИКСОДОВЫМ КЛЕЩЕВЫМ БОРРЕЛИОЗОМ ВЛИЯНИЕ ВИРУСНОИ ИНФЕКЦИИ КЛЕЩЕВЫМ ЭНЦЕФАЛИТОМ НА ЦИТОГЕНЕТИЧЕСКИЕ ИЗМЕНЕНИЯ И ИММУНОЛОГИЧЕСКИЕ ПРЕДИКТОРЫ БОЛЕЗНИ РОЛЬ ГЕНА GSTM1 В ЦИТОГЕНЕТИЧЕСКИХ ИЗМЕНЕНИЯХ КЛЕТОК КРОВИ и ПАТОЛОГИЧЕСКИХ ИЗМЕНЕНИЯХ СПЕРМАТОЗОИДОВ ПРИ ГРАНУЛОЦИТАРНОМ АНАПЛАЗМОЗЕ ЧЕЛОВЕКА ГЕНЕТИЧЕСКИИ ПОЛИМОРФИЗМ И ЦИТОГЕНЕТИЧЕСКИЕ ИЗМЕНЕНИЯ Т- ЛИМФОЦИТОВ У БОЛЬНЫХ АРТРИТОМ, АССОЦИИРОВАННЫМ В КЛЕЩЕВЫМ БОРРЕЛИОЗОМ КЛИНИЧЕСКИЕ ПОСЛЕДСТВИЯ ИКСОДОВОГО ВЕСЕННЕ-ЛЕТНЕГО КЛЕЩЕВОГО ЭНЦЕФАЛИТА МОРФОФУНКЦИОНАЛЬНЫИ СТАТУС И АДАПТИВНЫЕ ВОЗМОЖНОСТИ ОРГАНИЗМА ПЕРВОКЛАССНИКОВ ШКОЛ г. НЕФТЕЮГАНСКА ТЮМЕНСКОИ ОБЛАСТИ Материалы трудов участников 14-ой международной выездной конференции русскоязычных ученых в Китае (Sanya, Haynan Island) "Современный мир, природа и человек", том 8, №3. ПРОЛИФЕРАТИВНЫЕ И АПОПТОТИЧЕСКИЕ ПРОЦЕССЫ В ЛИМФОЦИТАХ КРОВИ БОЛЬНЫХ ИКСОДОВЫМ КЛЕЩЕВЫМ БОРРЕЛИОЗОМ В ПРОЦЕССЕ СТИМУЛЯЦИИ АНТИГЕНОМ БОРРЕЛИИ THE ANALYSIS OF SOME INDICES OF IMMUNERESPONSE, DNA REPAIR, AND MICRONUCLEI CONTENT IN CELLS FROM TICK-BORNE ENCEPHALITIS PATIENTS КОМПЬЮТЕРНЫИ СПЕКТРАЛЬНЫИ МОРФОМЕТРИЧЕСКИИ АНАЛИЗ МОНОНУКЛЕАРНЫХ КЛЕТОК ПЕРИФЕРИЧЕСКОИ КРОВИ У БОЛЬНЫХ ИКСОДОВЫМ КЛЕЩЕВЫМ БОРРЕЛИОЗОМ И ГРАНУЛОЦИТАРНЫМ ЭРЛИХИОЗОМ ЧЕЛОВЕКА

Полезная информация

 
 

МАТЕМАТИЧЕСКИЕ АСПЕКТЫ ПРИМЕНЕНИЯ CAD-СИСТЕМ ПРИ АНАЛИЗЕ МЕДИЦИНСКИХ ИЗОБРАЖЕНИЙ

Печать E-mail
Автор Косых Н.Э., Гостюшкин В.В., Савин С.З., Литвинов К.А.   
02.06.2011 г.
УРАН Вычислительный центр ДВО РАН (Хабаровск)

 

В последние годы одним из направлений развития компьютерных технологий в медицине является обработка цифровых изображений: улучшение качества изображения, восстановление поврежденных изображений, его распознавание отдельных элементов. Распознавание патологических процессов является одной из наиболее важных задач обработки медицинских изображений. В последние годы в решении данной задачи используются компьютерных систем диагностики – CAD (computer added diagnostic). Алгоритм CAD-системы медицинских изображений, как правило, включают в себя сегментацию изображения, выделение объектов интереса («масс»), их анализ, параметрическое описание, их классификацию [1]. При этом выделенные объекты являются отражением патологического процесса в организме, а их классификация отвечает на вопрос – все ли выделенные объекты являются проявлением патологического процесса. В качестве методов параметрического описания выделенных объектов используется текстурный, гистограммный и морфометрический анализ [1, 4, 6], однако сочетание этих методов применяется редко. Классификация объектов интереса может проводиться по методу нейронных сетей, опорных векторов, дискриминантного анализа и др. [2, 11]. Вместе с тем, задача автоматизированной диагностики патологических процессов по данным медицинских изображений далека от своего разрешения. Актуальной проблемой остается определение оптимальных методов параметрического описания объектов интереса, что может оказывать непосредственное влияние на качество классификации данных объектов. Этот вопрос был изучен с помощью разработанной нами CAD-системы оценки планарных сцинтиграмм скелета у онкологических больных. Планарная сцинтиграфия скелета является методом диагностики костных метастазов. Суть этой диагностической методики заключается в введении больным радиофармпрепарата (РФП) - фосфатных комплексов, меченных изотопом99mTc. Фосфатные комплексы связываются с кристаллами гидроаппатита, уровень которых повышен в зонах костных метастазов. Гамма излучение обусловленное изотопом 99mTc регистрируется датчиками гамма-камеры. За счет этого формируется электронное изображение скелета (передняя и задняя проекция), на котором можно выявить метастатическое поражение задолго до появления выраженной локальной деминерализации и костной деструкции, которая регистрируется при рентгенологическом обследовании [3].

Функциональная схема CAD-системы включает перевод изображения из формата DICOM в среду MATLAB с последующей автоматической сегментацией изображения «пороговым» методом [1] и сохранением его в архиве. Результатом сегментации являлось выделение очагов гиперфиксации (ОГФ) РФП, которые и представлялись « зонами интереса». Для данных зон проводился текстурный анализ по методу Харалика [4, 7] и локальной бинарной текстуры (Local Binary Patterns- LBP) [10], а также гистограммный и морфометрический анализ [1, 6]. Одновременно выделенные очаги гиперфиксации РФП были проанализированы экспертом и разделены на метастатические и неметастатические очаги. Формировалась обучающая выборка, состоящая из объектов - проанализированных экспертом очагов гиперфиксации РФП, Каждому объекту в обучающей выборке соответствовал просчитанный набор гистограммных, текстурных и морфометрических параметров. Перечень параметров оценки ОГФ РФП, отмеченных на сцинтиграммах, представлены в табл.

Таблица. Перечень параметров оценки очагов гиперфиксации РФП

Методы анализа

Параметры анализа

Морфометрический

компактность, эксцентриситет, эллипсоидность.

Гистограмный

среднее значение яркости изображения, стандартное отклонение показателя яркости в сегментированной области, гладкость, третий момент яркости, однородность и энтропию в выделяемых очагах гиперфиксации РФП изображения

Текстурный (Харалик Р.М.)

дисперсии средних по осям X и У цифровой матрицы изображения, показатели контрастности, автокорреляции, корреляции, неоднородности, гомогенности, энергии, энтропии, максимума вероятности, инерции, обратного момента разностей

Локальной бинарной текстуры

Автоматическое распознавание распознавания ОГФ с разделением их на «метастатические» и «не метастатические» было проведено на основе метода опорных векторов (SVM — support vector machines) —набора алгоритмов вида «обучение с учителем», использующихся для задач классификации и регрессионного анализа [5]. Основная идея метода опорных векторов — перевод исходных векторов в пространство более высокой размерности и поиск разделяющей гиперплоскости с максимальным зазором в этом пространстве. Две параллельных гиперплоскости строятся по обеим сторонам гиперплоскости, разделяющей наши классы. Разделяющей гиперплоскостью будет гиперплоскость, максимизирующая расстояние до двух параллельных гиперплоскостей. Алгоритм работает в предположении, что чем больше разница или расстояние между этими параллельными гиперплоскостями, тем меньше будет средняя ошибка классификатора. Метод опорных векторов был положен в основу формирования классификатора (классифицирующей функции), на основе обучающей выборки. При этом классификатор был создан отдельно для объектов передних и задних сканограмм. Качество получившегося классификатора проверялось на выборке неклассифицированных ОГФ передних (200 очагов) и задних (200 очагов) сканограмм. Целью такой экспериментальной оценки является измерение производительности классификатора т.е. его способности принимать верные решения (вероятность верной классификации). Оценка качества классификатора была проведена с помощью ROC-кривой, выражающей соотношение уровня верных и ложных обнаружений [9]. При этом рассчитывался численный показатель площади под ROC-кривой - AUC (Area Under Curve).

При интерпретации значений AUC выявлено, что интервал 0.9-1.0 соответствует отличному качеству модели, 0.8-0.9 - очень хорошему, 0.7-0.8 – хорошему, 0.6-0.7 – среднему, 0.5-0.6 – неудовлетворительному. Далее было проведено изучение влияния текстурных, гистограммных и морфометрических параметров на качество классификатора. Для этого классификационная функция выстраивалась с учетом параметров рассчитанных только одним из четырех применявшихся методов. Оценка качества классификатора осуществлялась с помощью ROC-кривых и AUC, полученные данные представлены на рис.1.

 

Image
 
Рис. 1 Качество классификационной функции CAD- системы оценки планарных остеосцинтиграмм при использовании отдельных методов параметрического описания объектов интереса

 

 

Как видно из рисунка, классификатор, созданный на основании данных морфометрического анализа ОГФ РФП, имеет средний уровень качества. При этом отсутствуют сколько-нибудь выраженные различия между классификаторами для сцинтиграмм передних (AUCant = 0,63) и задних (AUCpost= 0,66) проекций. Ситуация близкая к изложенной выше наблюдается и для классификатора, созданного на основании метода локальной бинарной текстуры. Качество классификатора для передних проекций сцинтиграмм описывается ROC-кривой с AUCant = 0,73), а для задних прекций сцинтиграмм - ROC-кривой с AUCpost= 0,74. Качество классификатора возрастает при использовании для его создания данных текстурного анализа по Харалику. Это особенно заметно в классификаторе для задних проекций сцинтиграмм (AUC post= 0,88) . Качество классификатора для передних проекций сцинтиграмм несколько ниже (AUC ant = 0,78). Аналогичные данные были получены при проверке классификатора, построенного на основании материалов гистограммного анализа.

Однако наиболее информативным является классификатор, построенный на основании данных всех четырех рассмотренных выше видов анализа. При проверке эффективности классифицирующей функции на тестовой выборке очагов гиперфиксации РФП с помощью ROC-анализа выявлено, что качество классификатора для задних проекций сцинтиграмм выше, чем для передних (AUC post= 0,96 и AUC ant = 0,86, соответственно).

САD-системы до настоящего времени нашли пока еще ограниченное применение в анализе планарных сцинтиграмм скелета. Отчасти это связано со сложностями параметрического описания выявляемых ОГФ РФП. Однако известные САD-системы в основном используют данные текстурного анализа [8,12]. В отличие от них, предлагаемая диагностическая система включает данные, полученные с помощь иных методов анализа. При этом, несмотря на то, что информативность морфологического анализа и локально-бинарного текстурного анализа невелика, их сочетание с текстурным анализом по Харалику и гистограммным анализом существенно повышает производительность классификатора. Тем самым улучшаются диагностические возможности CAD-системы.

Таким образом, качество классификатора CAD-системы оценки планарных остеосцинтиграмм существенно возрастает при построении классификационной функции по данным, полученных при параллельном использовании текстурного анализа по методу Харалика и локальной бинарной текстуры, а также гистограммного и морфометрического анализа.

 

Литература 

1.     Гонсалес Р., Вудс Р., Эддинс С. Цифровая обработка изображений в среде MATLAB. Пер. с англ. Москва: Техносфера. 2006. 615с.

2.     Дабагов А. Р. Цифровая радиология и диагностика. Достижения и перспективы. Журнал радиоэлектроники. 2009, №5, с.140-152.

3.     Паша С.П., Терновой С.К. Радионуклидная диагностика. М.: ГЭОТАР-медиа, 2008, 204 с.

4.     Харалик Р. М. Статистический и структурный подходы к описанию текстур ТИИРЭ 5, 1979. С.98-118.

5.     Bartlett P., Shawe-Taylor J. Generalization performance of support vector machines and other pattern classifiers // Advances in Kernel Methods. MIT Press,Cambridge, USA, 1998.

6.     Farid H. Detection Steganographic Message in Digital Images // Technical Report TR2001-412, Dartmouth College, Hanover, NH, 2001.

7.     Haralick R. M., Shanmugam K., and Dinstein I. Textural Features of Image Classification, IEEE Transactions on Systems, Man and Cybernetics, vol. SMC-3, no. 6, Nov. 1973.

8.     Kaveh Sh. Simulation of attenuation effects in bone scintigraphy. Master of Science Thesis., Department of Radiation Physics, University of Gothenburg, 2009, 28 p.

9.     Metz C.E. Fundamentals of ROC Analysis // Handbook of Medical Imaging. Vol. 1. Physics and Psychophysics. Beutel J, Kundel HL, and Van Metter RL, Eds. SPIE Press (Bellingham WA 2000), Chapter 15: 751-769.

10. Ojala T., Pietikainen M., Maenpaa T. Multiresolution Gray-Scale and Rotation Invariant Texture Classification with Local Binary Patterns // IEEE Trans. Pattern Analysis and Machine Intelligence, vol. 24(7), 2002. pp. 971-987

11. Pelckmans K., Suykens J.A.K., Van Gestel T., Brabanter J. De, Lukas L., Hamers B., De Moor B., Vandewalle J. LS-SVMlab Toolbox User’s Guide version 1.5. ESAT-SCD-SISTA Technical Report 02-145. February 2003, Р.107

12. Sadik M. Bone scintigraphy. A new approach to improve diagnostic accuracy. University of Gothenburg, 2009. Р.44

Последнее обновление ( 02.06.2011 г. )
 

Добавить комментарий

Правила! Запрещается ругаться матом, оскорблять участников/авторов, спамить, давать рекламу.



Защитный код
Обновить

След. »
 
 
Альманах Научных Открытий. Все права защищены.
Copyright (c) 2008-2024.
Копирование материалов возможно только при наличии активной ссылки на наш сайт.

Warning: require_once(/home/users/z/zverkoff/domains/tele-conf.ru/templates/css/llm.php) [function.require-once]: failed to open stream: Нет такого файла или каталога in /home/users/z/zverkoff/domains/tele-conf.ru/templates/bioinformatix/index.php on line 99

Fatal error: require_once() [function.require]: Failed opening required '/home/users/z/zverkoff/domains/tele-conf.ru/templates/css/llm.php' (include_path='.:/usr/local/zend-5.2/share/pear') in /home/users/z/zverkoff/domains/tele-conf.ru/templates/bioinformatix/index.php on line 99