|
ГОУ ВПО СибГМУ Росздрава (г. Томск)
Эта работа опубликована в сборнике "Науки о человеке": материалы IX
конгресса молодых ученых и специалистов (Томск, 28-29 мая 2010 г) / Под ред. Л.М.
Огородовой, Л.В. Капилевича. – Томск: СибГМУ. – 2010. – 113 с.
Посмотреть обложку сборника
Скачать сборник целиком
С точки зрения генетики бронхиальная астма (БА) является типичным мультифакторным заболеванием, развитие которого определяется сложным взаимодействием множества генов и факторов внешней среды. При анализе генетической компоненты подверженности БА получено несколько хороших примеров важности генетических взаимодействий в развитии этого заболевания. Предполагается, что отдельный генетический вариант имеет слабый индивидуальный эффект в отношении фенотипа, однако в синергизме с другими вариантами, этот эффект может заметно увеличиваться. Целью данного исследования является анализ межгенных взаимодействий у больных бронхиальной астмой.
Материал и методы. Осуществлено генотипирование с помощью ПДРФ-анализа следующих выборок: 102 больных БА и 120 здоровых индивидов. Все обследованные - русские в возрасте от 18 до 60 лет, проживающие на территории г. Томска. Исследовано десять полиморфных вариантов: rs2069705 IFNg, rs17880053 IFNgR2, rs 2070874 IL4, rs 1805010 IL4Ra, rs10905277 GATA3 rs11652969 TBX21, rs3760903 PIASY, rs12756687 PIAS3, rs16967593 STAT5p\ rs6737848 SOCS5. Продукты изученных генов являются цитокинами, их рецепторами и сигнальными молекулами внутриклеточной передачи сигналов, участвующими в Th1/Th2 поляризации. Оценка межгенных взаимодействий реализована с помощью биоинформационного метода Multifactor Dimensionality Reduction ( www.epistasis.org/mdr.html ).
Результаты и обсуждение. При анализе межгенных взаимодействий у больных БА выявлена оптимальная двухлокусная модель: SOCS5-IFNg (p<0,01). Предрасположенность к БА согласно полученной модели связана с носительством генотипов SOCS5 C/C и IFNg T/C, а также SOCS5 G/G и IFNg Т/Т (рис.1).
Рис.1 Графическое изображение модели межгенного взаимодействия IFNg-SOCS5
Несмотря на то, что функциональные механизмы взаимодействия изученных генов пока не вполне ясны, однако, на основании полученной модели можно предположить комплексное участие генов IFNg и SOCS5 в формировании фенотипа астмы. Наличие данных о межгенных взаимодействиях отчасти позволяют понять взаимодействия на уровне протеин-протен или протеин-ДНК [1]. Возможным механизмом вовлеченности изученных молекул в патогенез астмы является их совместная роль в негативной регуляции экспрессии гена IL4.
Таким образом, выявлено статистически значимое взаимодействие генов IFNg и SOCS5 у больных БА, которое является одним из возможных патогенетических механизмов развития заболевания.
Список литературы:
1. Methodological issues in detecting gene-gene interactions in breast cancer susceptibility: a population-based study in Ontario / L. Briollais, Y. Wang, I. Rajendram, J. Knight, H. Ozcelik // BMC Medicine. - 2007. - V. 5. - P. 1-15.
|
