|
Авторы: Шелепанов Ю.А., Осипова Л.П., Морозов И.В.
Межинститутский центр секвенирования ДНК, Институт биоорганической химии СО РАН, Институт цитологии и генетики СО РАН, г. Новосибирск
Эта работа опубликована в сборнике "НАУКИ О ЧЕЛОВЕКЕ" – Сборник статей молодых ученых и специалистов /Под ред. Л.М. Огородова, Л.В. Капилевич. – Томск, СГМУ.- 2002.-254 с.
Скачать сборник целиком
Изучение скорости мутирования геномов животных и растений, обитающих в районах техногенного загрязнения, позволяет дать лишь качественные оценки опасности для человека, что связано в первую очередь с межвидовыми различиями в чувствительности живых организмов к мутагенам. Поэтому данные о скорости мутационного процесса в популяциях человека являются наиболее адекватными для оценки генетического риска при увеличении загрязненности окружающей среды.
Для исследования нами выбрана популяция южных алтайцев Усть-Канского района Республики Алтай. Предполагается провести молекулярно-генетический анализ генофонда данной популяции для оценки мутационного темпа генома по выбранным маркерам. Мутации de novo предполагается идентифицировать по данным внутрисемейного анализа. В качестве маркеров нами выбраны локусы микро- и миниисателлитной ДНК, в том числе применяемые в прошлом для оценки последствий катастрофы на Чернобыльской АЭС в популяции людей, проживающих на территории Белоруссии [1]. Частота возникновения спонтанных мутаций в микро- и минисателлитной ДНК в 1000 раз выше, чем в структурных генах. Такие особенности позволяют в целом использовать их в качестве генетических маркеров для обнаружения последствий загрязнения окружающей среды на генном уровне при использовании небольших выборок. Среди локусов минисателитной ДНК нами выбран гипервариабельный CEB1 (D2S90), нестабильность этого локуса составляет от 0.4% до 13%[2,3].
Настоящее исследование включает:
1) Создание коллекции образцов крови выбранной популяций человека;
2) Выделение геномной ДНК из клеток крови;
3) ПЦР и ПДРФ анализ локусов минисателлитной ДНК;
4) Определение нуклеотидной последовательности ДНК для исследования структурного полиморфизма выбранных локусов;
5) Статистическая обработка результатов и оценка скорости мутирования локусов минисателлитной ДНК в популяции человека, и сравнение результатов с описанными ранее в литературе.
Нами проведен ряд экспедиций в Республику Алтай и создана коллекция ДНК популяций людей проживающих на данной территории.
На основе обобщения результатов исследования планируется создание системы диагностики, позволяющей адекватно оценивать последствия влияния техногенного загрязнения окружающей среды на генофонд популяций человека.
Литература
1. Dubrova YE, Nesterov VN, et al.(1998) Stage specificity, dose response, and doubling dose for mouse minisatellite germ-line mutation induced by acute radiation. Proc Natl Acad Sci U S A 26;95(11):6251-5.
2. Buard J, Vergnaud G. (1994) Complex recombination events at the hypermutable minisatellite CEB1 (D2S90).
EMBO J. 1;13(13):3203-10.
3. Buard J, Bourdet A, Yardley J, Dubrova Y, Jeffreys AJ. (1998) Influences of array size and homogeneity on
minisatellite mutation. EMBO J 1998 Jun 15;17(12):3495-502.
|
