Сибирский государственный медицинский университет, г. Томск
Кафедра медицинской генетики

Эта работа опубликована в сборнике статей по материалам Международной 69-й научной итоговой студенческой конференции, посвященной 200-летию со дня рождения Н.И. Пирогова (г.Томск, 11-13 мая, 2010 год); под реакцией академика РАМН В.В. Новицкого, член. корр. РАМН Л.М. Огородовой

Посмотреть титульный лист сборника

Скачать сборник целиком (1,4 мб)

 

Актуальность. Туберкулез (ТБ) – одно из тяжелых инфекционных заболеваний, смертность от которого ежегодно составляет более З млн. человек. Многочисленные молекулярно-генетические исследования, показывают, что восприимчивость к инфекционным агентам является генетически обусловленной. В настоящее время изучено большое количество маркеров предрасположенности к туберкулезу. Выявлено множество полиморфизмов, отвечающих за развитие и течение туберкулеза. В большинстве работ представлены сведения о связи генов интерлейкинов, их рецепторов и многих других генов, продукты которых задействованы в реализации противоинфекционного иммунитета. Тем не менее, важную роль в развитии инфекционных заболеваний, в том числе и туберкулеза, могут иметь гены, продукты которых участвуют в передаче внутриклеточного сигнала цитокинов. Потенциальной мишенью для исследования развития туберкулеза могут быть гены PIAS, которые ранее не изучались при данной патологии. PIAS (белки ингибиторы активированных STAT) влияют на транскрипционную активность STAT-белков, соединяясь с активированным STAT-димером [2]. Механизмы регуляции STAT активности с помощью PIAS белков до конца не изучены, однако однозначно известно, что это цитокин-зависимый процесс. Ген PIASY располагается на 19 хромосоме (19p13.3), ген PIAS3 расположен в регионе 1q21 [1]. В литературе не представлено сведений об ассоциациях полиморфизма генов  PIASY и PIAS3 с развитием инфекционных заболеваний, в том числе туберкулеза.
Цель исследования: изучить связь полиморфизма генов PIASY и PIAS3 с развитием туберкулеза в русской и тувинской популяциях.
Материал и методы. Для исследования использована ДНК больных туберкулезом (n=294) и здоровых индивидов (n=152), жителей Томской области, русских по национальности; больных туберкулезом (n=271) и здоровых индивидов (n=219), являвшихся представителями коренного населения Республики Тува из банка ДНК НИИ медицинской генетики СО РАМН. Средний возраст больных индивидов в русской популяции составил 31, 4 года и в контрольной группе – 31,7 лет. В тувинской популяции у больных индивидов средний возраст составил 33,5 года, а у здоровых – 33,1 года. В работе исследованы два полиморфных варианта генов PIASY (rs3760903) и PIAS3(rs12756687) с помощью ПЦР-ПДРФ анализа.
Результаты и обсуждение. Наблюдаемое распределение генотипов соответствовало ожидаемому при равновесии Харди-Вайнберга во всех изученных выборках (табл. 1). По изученному полиморфизму гена PIASY (rs3760903) наблюдается значительное различие частот генотипов между популяциями русских и тувинцев (р=0,000). У русских контрольной группы максимально представлен гетерозиготный генотип AG, его частота составляет 50,6%, у тувинцев контрольной группы наблюдается наибольшая частота генотипа АА (63,5%) и в порядке убывания генотипы располагаются следующим образом AA>AG>GG. Для гена PIAS3 (rs12756687) также наблюдается значительное перераспределение генотипов между контрольными группами русских и тувинцев (0,000). У русских наиболее часто встречается генотип GG (44,2%)  в отличие от тувинцев (8,3%).
При сравнении больных и здоровых в популяциях русских для варианта гена PIASY получены различия в распределении как частот генотипов (р=0,026) так и частот аллелей (р=0,010). Риск развития туберкулеза у носителей аллеля А увеличивается в 1,46 раза по сравнению с альтернативным аллелем (OR=1,46; 95% CI: 1,09-1,95; p=0,008). У тувинцев также обнаружена ассоциация гена PIASY с развитием туберкулеза (р=0,038 и р=0,032 для генотипов и аллелей соответственно). В тувинской популяции у индивидов носителей аллеля G риск развития туберкулеза увеличивается в 1,41 раза по сравнению с носителями аллеля А, а генотип АА наиболее часто встречается у здоровых (63,5%) и является протективным в отношении туберкулезной инфекции (OR=0,62; 95% CI: 0,43-0,91; p=0,011). По гену PIAS3 так же наблюдается перераспределение генотипов в популяциях русских и тувинцев. Если в исследуемых выборках больных и контроля Томской области в большем количестве представлены генотипы CG и GG, то среди тувинцев контрольной и опытной групп – CC и CG. Значительных отличий при сравнении генотипов между контрольной выборкой и больных туберкулезом как в русской популяции, так и у тувинцев не выявлено. Тем не менее при сравнении частот аллелей обнаружены значимые отличия в русской популяции: частота аллеля С значительно преобладала у больных и составила 40,6% (р=0,025).
Выводы: Таким образом, получены новые данные о связи полиморфных вариантов генов PIASY (rs3760903) и PIAS3(rs12756687) с развитием туберкулеза в русской и тувинской популяции.

                                                                                                                                   Таблица 1

Распределение генотипов и аллелей между контрольной группой и больными туберкулезом в русской и тувинской популяциях

Примечание: p¹ -  достигнутый уровень значимости по точному тесту Фишера между выборками больных и здоровых в русской популяции; p² – в тувинской популяции; критерий χ² использован для оценки наблюдаемого распределения генотипов ожидаемому при равновесии Харди Вайнберга.

Список литературы:
1.     Современные представления о JAK-STAT системе как новой сигнальной системе и её нарушениях при иммунной патологии / В. Н. Минеев, Л. Н. Сорокина // Аллергология. – 2006. - № 1. – С. 49-55.
Работа выполнена при поддержке грантов ФЦП №НК-116П/5 и гранта Президента РФ МК-2115.2009.7.