Целью проводимого нами исследования было изучение распределения частот высокополиморфных микросателлитных ТСТА-повторов, локализованных в 3 интроне гена PAH (STR аллели). По имеющимся литературным данным STR аллели гена PAH обнаруживают высокие межпопуляционные различия и выраженное неравновесие по сцеплению с определенными PAH мутациями, которые ведут к возникновению тяжелого наследственного заболевания - фенилкетонурии [1].
Материалом для исследования послужила ДНК, выделенная из крови 97 неродственных представителей казахской нации. Выделение ДНК из периферической крови обследуемых проводилось солевым методом с последующей хлороформ-фенольной очисткой и тестированием на 3% агарозном геле с различными концентрациями фага X. Генотипирование проводили путем амплификации ДНК в полимеразной цепной реакции (ПЦР) с применением специфичных олигонуклеотидных праймеров. ПЦР проводили на амплификаторе "Techne" Великобритания в 23 мкл реакционной смеси. Продукты амплификации анализировали с помощью электрофореза в 6%-ном полиакриламидном геле с окраской бромистым этидием.
При исследовании данной STR-системы в казахской популяции мы выявили 8 различных аллелей, отличающихся друг от друга на 4 п.н., что соответствует данным литературы, новых аллельных вариантов обнаружено не было.
Распределение частот STR аллелей для казахской популяции можно охарактеризовать как одномодальное с пиком в 244 п.о. В казахской популяции наиболее распространенным оказался аллель 244 (частота 0,268), что соответствует данным по другим популяциям мира [2]. Следующим по частоте встречаемости был аллель 248 (частота 0,253), который наиболее часто выявляется, по данным литературы [2], у тюрко-язычных народов (от 0,13 у чувашей до 0,18 у башкир). На третьем месте по частоте встречаемости у казахов находится аллель 240 (частота 0,196), тогда как в других популяциях этот аллель находится на втором месте. Сравнительный анализ распределения частот STR аллелей показал наличие достоверных различий казахской популяции по аллелю 232 с популяциями башкир и татар, по аллелю 248 с популяциями башкир и удмуртов, по аллелю 252 с популяциями русских, башкир и татар. Также обнаружено достоверное различие казахов по аллели 244 с русской популяцией. По остальным STR - аллелям гена ФАГ достоверных различий между популяциями не обнаружено.

 

 

* различия статистически достоверны (p<0,05)
Полученные данные по STR локусу гена PAH могут быть использованы при определении спорного отцовства, в судебно-медицинской идентификационной экспертизе и для косвенной пренатальной диагностики мутаций гена фенилаланингидроксилазы, ведущих к фенилкетонурии.