ФГУН ГНЦ ВБ «Вектор», п. Кольцово, Новосибирская обл.
Лаборатория молекулярной вирусологии РНК-содержащих вирусов
Эта работа опубликована в сборнике статей по материалам 70-й Юбилейной итоговой научной студенческой конференции им. Н.И. Пирогова (г. Томск, 16-18 мая 2011 г.), под ред. В. В. Новицкого, Л. М. Огородовой. − Томск: Сибирский государственный медицинский университет, 2011. − 430 с.
Актуальность: проблема заболеваний, переносчиками которых являются иксодовые клещи, в последнее десятилетие приобретает все большее значение для многих регионов России и в первую очередь для Западной Сибири. В Сибири отмечается резкое и устойчивое повышение уровня заболеваемости населения клещевым энцефалитом, иксодовым клещевым боррелиозом и клещевым риккетсиозом. Возрастанию интереса к этой группе инфекций способствует и появление «новых» и пока не изученных для России инфекций – гранулоцитарного анаплазмоза человека и моноцитарного эрлихиоза человека. У иксодовых клещей выявляются также вирус Западного Нила, бартонеллы и бабезии. Заболевания, вызываемые этими патогенами, а также микст-инфекции, при отсутствии надлежащего комплекса лабораторной диагностики могут ошибочно трактоваться как клинические проявления клещевого энцефалита [1]. Учитывая тот факт, что реальная роль вышеперечисленных клещевых патогенов в инфекционной патологии населения Западной Сибири изучена мало, сведения о степени распространенности различных возбудителей, а также их уточненный видовой состав в очагах клещевых инфекций на территории Российской Федерации имеют большое значение в научном и клиническом плане. Эти данные представляют практическую ценность для развития и совершенствования дифференциальной диагностики переносимых клещами инфекций у лиц, пострадавших от укусов клещей.
Материалы и методы: в исследование было взято 432 иксодовых клеща, собранных в городских и пригородных биотопах г. Томска летом 2010 г. Отлов клещей проводился сотрудниками кафедры зоологии позвоночных и экологии ТГУ методами сбора «на флаг» и с прокормителей – мелких животных и птиц. В исследование также вошли образцы органов мелких млекопитающих (89 образцов) и птиц (41 образец) - биоптаты мозга, печени, селезенки, мочевого пузыря и хрящевой ткани. Отлов животных производился на территории двух городских биотопов – «Университетская роща» и «Южное кладбище» и двух пригородных – «ТНХК» и «с. Коларово». Отлов птиц производили на берегу р. Томь. Собранные образцы хранили при -70ºC и далее гомогенизировали. Выделение нуклеиновых кислот производили с использованием наборов РИБОСорб (Интерлабсервис, Россия). Комплементарные ДНК синтезировали с использованием обратной транскриптазы Mo-MuLV (Медиген, Россия). Амплификацию осуществляли в 30 мкл смеси, содержащей 2 ед. Taq ДНК-полимеразы (Медиген, Россия). Продукты амплификации разделялись на 2 % агарозном геле в однократном буфере ТАЕ. Гель рассматривали на УФ трансиллюминаторе TCP-20 MC (Wilber Lourmat, Франция) и фотографировали с использованием системы видеодокументирования КРС-650 ВН (KT&C, Южная Корея) Для выделения продуктов амплификации из агарозного геля использовали набор Wizard SV Gel (Promega, USA). Определение нуклеотидных последовательностей продуктов амплификации проводили с использованием автоматического секвенатора Beckman Coulter CEQ2000 XL. Обработка последовательностей проводилась с использованием специализированных программных пакетов MEGA 4 (PSU, США).
Результаты исследования представлены в таблице 1.
Таблица 1
Инфицированность исследуемых проб различными патогенами.
|
|
Млекопитающие |
Птицы |
Клещи |
Всего исследовано |
21 особь |
14 особей |
432 особи |
Из общего числа: |
абс. (n) |
отн. (%) |
абс. (n) |
отн. (%) |
абс. (n) |
отн. (%) |
Инфицированных: |
- ВКЭ |
4 |
19,1 |
3 |
20 |
19 |
4,4 |
- ВЗН |
1 |
4,8 |
- |
- |
13 |
3,1 |
- боррелиями |
9 |
42,9 |
7 |
46,7 |
83 |
19,7 |
- риккетсиями |
5 |
23,8 |
- |
- |
49 |
11,6 |
- бартонеллами |
3 |
14,3 |
3 |
20 |
12 |
2,8 |
- анаплазмами |
3 |
14,3 |
1 |
6,7 |
5 |
1,2 |
- эрлихиями |
2 |
9,5 |
- |
- |
21 |
4,9 |
- бабезиями |
2 |
9,5 |
- |
- |
18 |
4,3 |
Неинфицированных |
5 |
23,8 |
4 |
28,6 |
249 |
57,3 |
Микст-инфекции |
Инфицированные
хотя бы одним патогеном |
16 |
76,2 |
10 |
71,4 |
183 |
42,7 |
Инфицированные
одновременно: |
-2мя патогенами |
2 |
9,5 |
2 |
14,3 |
28 |
6,5 |
-3мя
патогенами |
4 |
19,1 |
- |
- |
6 |
1,4 |
-4мя
патогенами |
- |
- |
- |
- |
1 |
0,2 |
Примечание: ВКЭ – вирус клещевого энцефалита; ВЗН – вирус Западного Нила.
Выводы: С помощью секвенирования фрагмента 5'-нетранслируемой области для вирусных инфекций и генов рибосомальных РНК для бактериальных и протозойных инфекций была подтверждена принадлежность исследуемых патогенов к следующим генотипам: ВКЭ к изоляту Kolarovo-2008; боррелий к Borrelia recurrentis A1 и Borrelia burgdorferi № 40; бабезий к Babesia microti; эрлихий к Ehrlichia canis, риккетсий к Rickettsia tarasevichiae.
Список литературы:
1. Analysis of the long-term dynamics of tick-borne encephalitis and ixodid tick-borne borrelioses morbidity in Russia / Е. Korenberg, Т. Likhacheva // Int. J. Med. Microbiol. – 2006. - №1. – Р. 54-58.
|