|
Сибирский государственный медицинский университет, (г. Томск);
НИИ Медицинской генетики ТНЦ СО РАМН, (г. Томск)
Эта работа опубликована в сборнике "Науки о человеке": материалы VI конгресса молодых ученых и специалистов / Под ред. Л.М. Огородовой, Л.В. Капилевича. – Томск: СибГМУ. – 2005. – 120 с.
Скачать сборник целиком
Изучение закономерностей наследования болезней человека невозможно без точного представления популяционной картины распространения полиморфных локусов изучаемых генов. Распространенность функционально значимых полиморфизмов может варьировать в зависимости от этнической истории популяции. Между тем, население Сибири с ее многонациональным составом остается недостаточно изученным по полиморфным локусам генов-кандидатов широко распространенных заболеваний. Учитывая суровые климатические условия региона, представляет интерес изучение генов, задействованных в энергетическом обмене.
Белки, участвующие в процессах энергетического взаимодействия, кодируются как митохондриальным, так и ядерным геномом. Одним из ядерных генов - регуляторов энергообмена является ген POLG, кодирующий митохондриальную ДНК-полимеразу у. В современной классификации митохондриальных болезней выделен целый раздел клинических состояний, вызванных мутациями в POLG [2]. Данных о функциональной значимости полиморфизмов в некодирующих областях данного гена нет. Однако показано, что влияние локуса на формирование признака может быть обусловлено не столько изменением функции белкового продукта, сколько изменением уровня экспрессии гена.
С целью изучения генетического разнообразия коренных жителей Сибири по локусу rs758130 в гене POLG, были изучены жители пос. Бешпельтир (Республика Алтай) и жители пос. Чериктей (Республика Саха-Якутия). Данный полиморфизм ранее не был изучен у населения России.
ДНК выделяли по стандартной неэнзиматической методике из лимфоцитов периферической крови, взятой из кубитальной вены [1]. Выделенную ДНК замораживали и хранили при температуре - 20С0. Для изучения полиморфизма A-G в первом интроне POLG (rs758130) [3]. проводили амплификацию участка гена методом ПЦР, используя праймеры, подобранные с использованием программы Primer3. Ам-плификат обрабатывали рестриктазой TaqI при температуре 650C в течение 24 часов. Продукты рестрикции фракционировали в 3% агароз-ном геле. Аллель А соответствовал нерестрицированному продукту ПЦР длиной 386 п. н., аллель G - появлению фрагментов длиной 244 п. н. и 142 п. н. Фрагменты ДНК окрашивали бромистым этидием и визуализировали с использованием системы гель-документирования компании BioRad. Проверку соответствия распределения генотипов равновесию Харди-Вайнберга и сравнение частот аллелей между выборками проверяли с помощью критерия X2. Было исследовано 175 жителей в пос. Чериктей и 137 жителей в пос. Бешпельтир. Данные о частотах полиморфизма представлены в таблице.
|
Таблица
Частоты генотипов и аллелей полиморфизма гена POLG |
| Генотип\поселок |
АА |
AG |
GG |
Частота аллеля G |
| Бешпельтир (N=137) |
0,3504 |
0,5401 |
0,1095 |
0,3796 |
| Чериктей (N=175) |
0,3885 |
0,5257 |
0,0857 |
0,3485 |
| Токио, Япония (N=44)3 |
0,477 |
0,432 |
0,091 |
0,307 |
| Бейджинг, Китай (N=45)3 |
0,444 |
0,467 |
0,089 |
0,322 |
ло 0,5. Аллель G встречался с частотой 38% у алтайцев и 35% у якутов. При сравнении частот аллелей и генотипов различий между популяциями не было выявлено.
Сравнение полученных результатов с данными, доступными в базе данных SNP [3]. Также не показало существенных отличий от изученных популяций монголоидного происхождения. Таким образом, распространенность данного полиморфизма не имеет выраженной межэтнической дифференциации в пределах монголоидной расы.
Работа выполнена при частичной финансовой поддержке грантов РФФИ №04-04-792а и №04-04-532а.
Литература:
1. Маниатис Т., Фрич Э. «Молекулярное клонирование». - М.: Мир. - 1984. - С. 99-104.
2. Ponamarev M. V. // J. Biol. Chem., 2002, Vol. 277, №18, - P. 15225-28.
3. http://www.ncbi.nlm.nih.gov/SNP/snp_ref.cgi?rs=758130
|
