Сибирский государственный медицинский университет, г. Томск

ФГБУ «НИИ медицинской генетики» СО РАМН , лаборатория популяционной генетики

Эта работа опубликована в сборнике статей по материалам 71-й итоговой научной студенческой конференции им. Н.И. Пирогова (г. Томск, 14-16 мая 2012 г.), под ред. В. В. Новицкого, Н.В. Рязанцевой. − Томск: Сибирский государственный медицинский университет, 2012. − 335 с. 

Скачать сборник (MS Word, 1 мб)

Скачать программу конференции 

Актуальность. Бронхиальная астма (БА) − клинически гетерогенное заболевание, реализация которого определяется взаимодействием генетических и средовых факторов. Различные подходы, используемые для поиска генов подверженности БА, включая исследование генов-кандидатов, анализ сцепления, полногеномный анализ ассоциаций (ПГАА), позволили охарактеризовать влияние генетических факторов на проявление заболевания. Наиболее масштабный ПГГА, направленный на выявление генетических факторов развития БА, выполнен в рамках международного проекта GABRIEL 6-й Рамочной программой Европейского Сообщества, в ходе которого установлены новые гены-кандидаты подверженности БА - YWHAB и PPP1R12B, а также ряд других генов, влияющих на развитие других атопических заболеваний. Однако выявленные в результате ПГГА гены нуждаются верификации в независимых исследованиях. Поэтому актуальной задачей является оценка значимости результатов ПГАА в разных популяциях.

Цель. Изучить связь полиморфизма гена YWHAB с развитием БА у жителей г. Томска и Томской области

Материал и методы. Для исследования использованы образцы ДНК, предоставленные банком ДНК ФГБУ "НИИ медицинской генетики" СО РАМН. Выборку составили больные БА (n=115, средний возраст 42,3 года) и здоровые индивиды (n=59, средний возраст 35,4 лет). Генотипирование проводили с помощью ПЦР-ПДРФ анализа, применяя праймеры (производитель ООО 'Биоссет'), фланкирующие искомый участок гена YWHAB (rs6031849) и эндонуклеазу рестрикции (BstMCI, производитель НПО 'Сибэнзим'). Продукты амплификации и рестрикции визуализировали в 3% агарозном геле в УФ-свете. Для статистических расчетов использовали доступный on-line ресурс http://ihg2.helmholtz-muenchen.de/ihg/snps.html.

Результаты. В контрольной группе наблюдаемое распределение генотипов соответствовало ожидаемому при равновесии Харди-Вайнберга (χ2=0,5639; р=0,4527). Исследуемые группы характеризуются значительным аллельным разнообразием, так наблюдаемая гетерозиготность достигает 0,4407 у здоровых индивидов и 0,2957 у больных. Частота аллеля Т составила 27,1+3,85 у здоровых лиц и 28,7+3,37 у больных; при сравнении двух групп различий по частотам аллелей не выявлено (р=0,75684).Частоты гомозигот GG у больных и здоровых были сходными (56,5% и 50,8% соответственно). Частота генотипа TT выше у больных (13,91%) по сравнению с контролем (5,08%), однако эти различия статистически не значимы (p=0,07713). При попарном сравнении генотипов между группами больных и здоровых индивидов наблюдали значимые различия в распределении генотипов TT и TG (χ2=4,71; р=0,02995), что свидетельствует о возможной связи данного полиморфного варианта с развитием заболевания.

Выводы. Таким образом, полученные данные дают возможность предположить наличие связи полиморфного варианта гена YWHAB (rs6031849) с развитием БА у жителей г. Томска и Томской области, однако для подтверждения необходимы дальнейшие исследования.